قد يسبب الاستخدام العشوائي لغسول الفم دون استشارة طبية الإصابة بردود فعل تحسسية وخللاً في الميكروبيوم الفموي، الذي قد يرتبط أيضاً بضعف صحة الجسم، وظهور مقاومة المضادات الحيوية. لذا يُنصح بعدم استخدام الغسول الفموي دون استشارة طبية.