على الرغم من أن الخفافيش تحمل وتنقل العديد من الأمراض التي قد تسبب مشكلات صحية خطيرة للبشر مثل الإيبولا والسارس، إلا أن جهاز الخفافيش المناعي يتمتع بقدرة خاصة على التكيف مع الفيروسات، مما يجعل تأثيرها على الخفافيش ضئيلاً.